No ano de 1999, a FINEP inicia a criação do INOVAR em parceria com o Fumin/BID, com o objetivo de apoiar as empresas inovadoras através de um programa estruturado de venture capital.
Assim, em maio de 2000 nasce o INOVAR I. Entre outras realizações desta ação, destaca-se a participação na criação da ABVCAP, as parcerias com fundos de pensão e agentes de fomento visando ao investimento em fundos, e a realização de diversos fóruns para aproximar empresas e investidores.
Em julho de 2008 inicia-se o INOVAR II, com a meta de promover ações para consolidar a indústria de venture capital e private equity, e contribuir para a estruturação de uma indústria de capital semente no Brasil.